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C9高校和985高校的差距主要体现在以下几个方面：

学科建设：985高校在学科建设上更加强大，拥有更多的一流学科和研究中心，而C9高校在某些学科上还需要进一步提升。

师资力量：985高校拥有更多的知名教授和优秀的科研团队，而C9高校在这方面还需要加强。

学术影响力：985高校在国内外学术界的影响力更大，其学术成果和研究成果更受重视，而C9高校在这方面还需要进一步提升。

资金投入：985高校拥有更多的资金投入，可以更好地支持学科建设和科研工作，而C9高校在这方面还需要加强。

总之，C9高校和985高校在学科建设、师资力量、学术影响力和资金投入等方面存在一定的差距，但C9高校也在不断努力提升自己的实力和影响力。